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所得稅法第75條

營利事業遇有解散、廢止、合併或轉讓情事時，應於截至解散、廢止、合併或轉讓之日止，辦理當期決算，於四十五日內，依規定格式，向該管稽徵機關申報其營利事業所得額及應納稅額，並於提出申報前自行繳納之。
營利事業在清算期間之清算所得，應於清算結束之日起三十日內，依規定格式書表向該管稽徵機關申報，並於申報前依照當年度所適用之營利事業所得稅稅率自行計算繳納。但依其他法律得免除清算程序者，不適用之。
前項所稱清算期間，其屬公司組織者，依公司法規定之期限；其非屬公司組織者，為自解散、廢止、合併或轉讓之日起三個月。
獨資、合夥組織之營利事業應依第一項及第二項規定辦理當期決算或清算申報，無須計算及繳納其應納稅額；其營利事業所得額，應由獨資資本主或合夥組織合夥人依第十四條第一項第一類規定列為營利所得，依本法規定課徵綜合所得稅。
營利事業未依第一項及第二項規定期限申報其當期決算所得額或清算所得者，稽徵機關應即依查得資料核定其所得額及應納稅額；其屬獨資、合夥組織之營利事業者，稽徵機關應於核定其所得額後，將其營利事業所得額直接歸併獨資資本主或合夥組織合夥人之營利所得，依本法規定課徵綜合所得稅。
營利事業宣告破產者，應於法院公告債權登記期間截止十日前，向該管稽徵機關提出當期營利事業所得稅決算申報；其未依限申報者，稽徵機關應即依查得之資料，核定其所得額及應納稅額。
法院應將前項宣告破產之營利事業，於公告債權登記之同時通知當地稽徵機關。

財政部86/05/07台財稅第861894479號函內容：

關於獨資組織營利事業於辦妥負責人或商號變更登記後，經查獲變更前有違反稅法規定情事，究應以變更前抑或以變更後之商號及負責人為處罰對象乙案。

說明：二、獨資組織營利事業對外雖以所經營之商號名義營業，實際上仍屬個人之事業，應以該獨資經營之自然人為權利義務之主體，又獨資商號如有觸犯稅法上之違章事實應受處罰時，亦應以該獨資經營之自然人為對象。是故，本案應以違章行為發生時登記之負責人為論處對象。

獨資事業變更負責人即使無償轉讓仍應開立統一發票

獨資商號於商業登記上雖為負責人變更，實際上係其商號權利義務轉讓；又原負責人將商號之存貨及固定資產頂讓與新負責人時，應依銷售貨物開立統一發票並報繳營業稅，縱使為無償轉讓，依法視為銷售貨物，獨資組織之營利事業變更負責人，將存貨及固定資產轉讓與新負責人，應依規定開立銷貨統一發票；即使為無償轉讓，依法視為銷貨，仍應開立統一發票。

阿甘創業加盟網提醒開店商家特別是加盟連鎖經營業者，獨資商號店家之營利事業，如有頂讓轉讓變更負責人時，因獨資商號無獨立之人格，以該商號為營業，所生權利義務全然歸屬出資個人，雖原商號名稱繼續使用，但已非原營業人之商號，而為新營業人人格之商號，雖營業人統一編號仍相同，但其負責人已變更，新負責人應攜帶相關章證，向國稅局換領統一發票購票證，且不論是有償或無償頂轉讓存貨及固定資產與新負責人，均應依規定開立銷貨統一發票，以免受罰。

但阿甘創業加盟網提醒開店商家經營業者特別是開店連鎖加盟業者，合夥組織之營利事業變更負責人或合夥人，如其營利事業主體並未因此而有解散、廢止或轉讓之情事，依規定可免辦理當期決算及清算申報。