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一般而言加盟權利金是使用加盟品牌商標、商譽的費用，此外有些加盟總部會要求加盟店須分擔品牌行銷費或是支付管理月費、輔導月費等。加盟權利金支付方式不同於一次給付的加盟金，加盟權利金大致上給付方式是採每年或每月支付，有定額或抽營業額比率兩種。 由於權利金是按月或按年持續性的給付，有一些加盟總部會在簽加盟合約時，以方便或是公司規定為由，要求加盟開店創業者一次即開足合約期限內不同到期年份支票給付加盟權利金，然加盟連鎖經營實務上卻發生過有一加盟開店創業者一次開齊五年權利金的支票繳交給加盟總部，加盟分店因生意不佳早已停業，加盟總部仍將已收取的支票續軋進銀行取款的加盟爭議事件。

為避免日後加盟總部應退還加盟開店創業者的支票卻沒退還風險，建議加盟開店創業者若加盟遇總部要求一次開齊合約期限內，全部權利金的支票面額時，務必要記得在加盟合約上加註，若發生中途解約，加盟分店不再續用商標、商譽時，總部必須無條件立即退還未到期的權利金支票，以保障加盟開店創業者的自身權益，然如加盟權利金金額不低，最還是和加盟總部協商改成逐年給付權利金，最為保險。

(此照片與內文無關)

加盟總部會向加盟者收取那些費用

一般而言，國內加盟總部會向加盟者收取三種費用，分別是加盟金、權利金及保證金。

加盟金，指的是總部在開店前幫加盟者做整體規劃及教育訓練所收取的費用。 在加盟權利金收取方面，由於加盟總部提供本身既有的經營管裡技術服務商標、品牌商譽，授權予加盟主去做商業方面的用途，因此，總部才能向加盟主收取這一方面的權利使用費用，而加盟權利金的收取，在國外加盟體系開店之後仍繼續收取的較多，國內加盟體系開店之後仍繼續收取的較少，加盟權利金計量方式有採定額定量的收取、依坪數多少收取、依授權範圍收取、依營業毛利額的百分比收取、行銷費、…等，因為定額收取費用簡單易懂易做的特性所以國內外加盟總部最喜歡採用定額收取費用的方式。只要加盟店持續使用總部的商標，就必須定期付費，所以加盟權利金是一種持續性的收費，支付期限可能是一年一次、按季或是按月支付。

保證金收取，茲因總部為確保加盟者會確實履行合約，並準時支付貨款等所收取的保證費，合約解除後須無息退還加盟者。總部通常會有不同的付款方式供加盟主選擇如：現金支付、不動產設定抵押、以及簽商業本票…等。

 收取加盟權利金加盟金須開統一發票

外商國際加盟連鎖企業總公司在台灣設有固定營業場所分公司，有收取台灣加盟店的權利金與加盟金或是收取電視廣告成本分攤費，台灣分公司即應依加值型及非加值型營業稅法開立統一發票，且其營利事業所得稅由台灣分公司跟當期營業所得稅結算合併一起申報。

有一知名餐飲加盟連鎖國際外商案例，沒有按照稅法規定開給加盟店權利金、加盟金統一發票，漏報營業稅及營利事業所得稅，被國稅局罰補稅及罰鍰6,000萬元。95年至98年外商國際企業總公司收取台灣加盟店的權利金與加盟金，總計要補繳700萬元、裁罰500萬元。另台灣分公司向加盟店收取電視廣告成本分攤費，亦未開立統一發票，外商國際企業台灣分公司聲稱，電視廣告費用是「代收轉付」，因此不必申報，但國稅局查核後發現，台灣分公司向加盟店收取銷售總額3%的費用做為電視廣告費，跟實際做為電視廣告總數之間金額有差額，故國稅局認為不符「代收轉付」免課稅條件，94年至98年須補繳400萬元；另營利事業所得稅方面，台灣分公司還須補繳95至97年營利事業所得稅共2,200萬元，國稅局裁罰2,200萬元。