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相關法律條文

所得稅法第39條
以往年度營業之虧損，不得列入本年度計算。但公司組織之營利事業，會 計帳冊簿據完備，虧損及申報扣除年度均使用第七十七條所稱藍色申報書 或經會計師查核簽證，並如期申報者，得將經該管稽徵機關核定之前十年 內各期虧損，自本年純益額中扣除後，再行核課。 本法中華民國九十八年一月六日修正之條文施行前，符合前項但書規定之 公司組織營利事業，經稽徵機關核定之以前年度虧損，尚未依法扣除完畢 者，於修正施行後，適用修正後之規定。

所得稅法第42條
公司組織之營利事業，因投資於國內其他營利事業，所獲配之股利淨額或 盈餘淨額，不計入所得額課稅，其可扣抵稅額，應依第六十六條之三規定 ，計入其股東可扣抵稅額帳戶餘額。 教育、文化、公益、慈善機關或團體，有前項規定之股利淨額或盈餘淨額 者，不計入所得額課稅，其可扣抵稅額，不得扣抵其應納所得稅額，並不 得申請退還。

稅捐稽徵法第48之1條
納稅義務人自動向稅捐稽徵機關補報並補繳所漏稅款者，凡屬未經檢舉、 未經稅捐稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查之案件，下列之處罰 一律免除；其涉及刑事責任者，並得免除其刑：
一、第四十一條至第四十五條之處罰。
二、各稅法所定關於逃漏稅之處罰。 營利事業應保存憑證而未保存，如已給與或取得憑證且帳簿記載明確，不 涉及逃漏稅捐，於稅捐稽徵機關裁處或行政救濟程序終結前，提出原始憑 證或取得與原應保存憑證相當之證明者，免依第四十四條規定處罰；其涉 及刑事責任者，並得免除其刑。 第一項補繳之稅款，應自該項稅捐原繳納期限截止之次日起，至補繳之日 止，就補繳之應納稅捐，依原應繳納稅款期間屆滿之日郵政儲金匯業局之 一年期定期存款利率按日加計利息，一併徵收。

營利事業所得稅查核準則第99條
投資損失：
一、投資損失應以實現者為限；其被投資之事業發生虧損，而原出資額並 未折減者，不予認定。
二、投資損失應有被投資事業之減資彌補虧損、合併、破產或清算證明文件。被投資事業在國外者，應有我國駐外使領館、商務代表或外貿機 關之驗證或證明；在大陸地區者，應有行政院大陸委員會委託處理臺灣地區與大陸地區人民往來有關事務之機構或團體之證明。
三、因被投資事業減資彌補虧損而發生投資損失，其需經主管機關核准者，以主管機關核准後股東會決議減資之基準日為準；其無需經主管機關核准者，以股東會決議減資之基準日為準。
四、因被投資事業合併而發生投資損失，以合併基準日為準。
五、因被投資事業破產而發生投資損失，以法院破產終結裁定日為準。
六、因被投資事業清算而發生投資損失，以清算人依法辦理清算完結，結算表冊等經股東或股東會承認之日為準。
七、公司依廢止前促進產業升級條例第十二條規定提列之國外投資損失準備，自提列年度起五年內若無實際投資損失發生時，應將提列之準備轉作第五年度之收益課稅。
八、營利事業因解散、撤銷、廢止或轉讓，依所得稅法規定計算清算所得時，其國外投資損失準備餘額有累積餘額，應轉作當年度之收益課稅 。

短漏報情節輕微者才適用盈虧互抵規定

國稅局近日查獲某公司年度出售下腳料收入，誤列為營業成本加項，造成營業成本虛增，導致短漏報課稅所得額達300餘萬元，稅額51萬餘元，然因短漏報課稅所得額占全年所得額之比例超過5％，且稅額已超過新臺幣10萬元，無法視為短漏報情節輕微，遂否准該公司當年度適用前10年虧損扣除，並予以補稅處罰。

所得短漏報情節重大不適用盈虧互抵
國稅局查獲經會計師簽證申報甲公司有短漏報政府補助款情事，因短漏報所得額依當年度稅率計算之金額超過新台幣10萬元，且短漏報課稅所得額占全年核定可供以後年度扣除虧損金額比例超過5%，短漏報情節重大，不得適用盈虧互抵之規定。

阿甘創業加盟網提醒創業者、開店商家經營業者特別是連鎖加盟業者，平時帳務處理應依一般公認會計原則詳實記錄，出售下腳料收入應申報為營業成本減項或其他收入，如因帳務處理不慎而有短漏報情形，營利事業應及時依稅捐稽徵法第48之1規定自動補報補繳，除可免除處罰外，同時可適用盈虧互抵，以維護自身權益。