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中小企業發展條例第36條

中小企業得在不超過已收資本額一倍之限度內，保留盈餘，不予分配；超過以上限度而不分配者，就其每一年度再保留之盈餘，於加徵百分之十營利事業所得稅後，不受所得稅法之限制。

八十七年度及以後年度之保留盈餘，應依所得稅法規定辦理，不適用前項規定。

中小企業發展條例第36-1條

中小企業開發公司對成立未滿五年之中小企業投資，得經中央財政主管機關核准，按其投資總額百分之二十範圍內，提撥投資損失準備，供實際發生損失時充抵之。在提撥五年內若無實際投資損失發生時，應將提撥之準
備轉作第五年度收益處理。
公司因解散、撤銷、廢止、合併或轉讓依所得稅法第七十五條規定計算清算所得時，依前項規定提撥之投資損失準備有累積餘額者，應轉作當年度收益處理。

中小企業發展條例第36-2條

為因應國際經濟情勢變化，促進國內中小企業投資意願及提升國內就業率，經濟景氣指數達一定情形下，新投資創立或增資擴展之中小企業達一定投資額，增僱一定人數之員工且提高該企業整體薪資給付總額時，得就其
每年增僱本國籍員工所支付薪資金額之百分之一百三十限度內，自其增僱當年度營利事業所得額中減除。
中小企業於本條適用期間，不符合前項要件，自不符合要件之年度起，依所得稅法規定計算其營利事業所得額及應納稅額。
第一項經濟景氣指數達一定情形、適用期間、投資額、增僱員工之對象及人數、企業整體薪資給付總額、核定機關、申請期限、申請程序及其他相關事項，由行政院定之。

中小企業發展條例第36-3條

產業創新條例中如有與本條例相同性質之租稅優惠，中小企業僅得擇一適
用。

中小企業增僱員工薪資費用加成減除辦法
第 1 條
本辦法依中小企業發展條例（以下簡稱本條例）第三十六條之二第三項規定訂定之。
第 2 條
本辦法所稱中小企業，指依法辦理公司或商業登記，並合於中小企業認定標準第二條之事業。但不包括所得稅法施行細則第五十六條第一項免課營利事業所得稅之小規模營利事業。
本辦法所稱經濟景氣指數達一定情形，指行政院主計總處按月發布之失業率連續六個月高於一定數值，且經中央主管機關認定公告者。
前項經濟景氣指數達一定情形，中央主管機關自本辦法施行之日起，應每二年檢討調整之。
第 3 條
經濟景氣指數達一定情形時，除第九條情形外，自中央主管機關公告生效日起連續二年內，中小企業符合本辦法規定增僱本國籍員工者，得申請適用本條例第三十六條之二第一項加成減除營利事業所得額之優惠（以下簡稱申請優惠）。前項優惠適用期間，自中央主管機關公告生效日起至本辦法施行期間屆滿之日不足二年者，其申請優惠適用期間至本辦法施行期間屆滿之日止。
第 4 條
申請優惠之中小企業，應符合下列要件：
一、自中央主管機關公告經濟景氣指數達一定情形之生效日起，依法完成公司或商業設立登記或增資變更登記，不包括原企業合併、分割、轉讓、或解散而未實質增僱員工者。
二、新投資創立之實收資本額或增資擴展之增加實收資本額達新臺幣五十萬元，且企業淨值應為正值。
三、當年度自中央主管機關公告經濟景氣指數達一定情形之生效日起，增僱二人以上本國籍員工。
四、當年度本國籍員工勞工保險平均月投保人數較前一會計年度本國籍員工勞工保險平均月投保人數增加二人以上；如於會計年度中增僱未滿一年者，該會計年度增僱後之經常僱用員工數較增僱前之經常僱用員工數增加二人以上。
五、當年度增僱本國籍員工後之整體薪資給付總額高於比較薪資水準總額；如於會計年度中增僱未滿一年者，其比較薪資水準總額應按增僱期間相當全年之比例計算，增僱期間不滿一月者，以一月計算。
六、增僱本國籍員工之薪資相當或高於當年度中央勞動主管機關公告之基本工資。
於前項第一款公告之生效日起完成公司或商業設立登記者，不受前項第四款及第五款規定之限制。
第一項第四款後段所定經常僱用員工數，以該會計年度增僱時點前後之中小企業本國籍員工每月勞工保險平均月投保人數比較之。
第一項第五款所稱比較薪資水準總額，指前一年度薪資給付總額，加計前一年度薪資給付總額乘以基準僱用比例之百分之三十計算之總額；所稱基準僱用比例，指當年度增僱本國籍員工人數占前一年底總僱用人數之比例。計算公式如下：比較薪資水準總額＝前一年度薪資給付總額＋前一年度當年度增僱本國籍員工人數
薪資給付總額ｘ────────────ｘ30% 。
　 前一年度總僱用人數第一項第五款之整體薪資給付總額，應符合營利事業所得稅查核準則第七十一條規定之範圍為準，但不包含非本國籍員工薪資給付額之部分。
第 5 條
中小企業有下列情形之一者，不得申請優惠：
一、提供之增僱工作機會，位於中華民國境外。
二、提供之增僱工作機會，係屬部分工時或定期契約之性質。
三、屬經營舞廳、舞場、酒家、酒吧、特種咖啡茶室之行業或人力派遣服務業。
四、使用票據經拒絕往來尚未恢復往來，或於最近三年內有欠繳已確定應納稅捐情事。
五、收購他企業之營業或財產而增僱員工，或屬公司法第三百六十九條之一所稱關係企業間人員流動之情形。
六、增僱行為違反民法第一百八十四條、公平交易法第十九條第三款、第五款、第二十四條或營業秘密法第十條規定，經主管機關處分確定或司法機關判決確定。
七、最近三年內違反環境保護、勞工、食品安全衛生相關法律且情節重大，經主管機關處分確定或司法機關判決確定。
中小企業無前項規定情形，應以切結書聲明之。
第 6 條
申請優惠之中小企業，應於辦理當年度營利事業所得稅結算申報時依規定格式填報，並檢附下列文件，送請公司或商業登記所在地之稅捐稽徵機關核定本條例第三十六條之二第一項加成減除營利事業所得稅之數額：
一、中小企業增僱員工薪資費用加成減除申請表。
二、公司或商業設立登記或增資變更登記之文件影本。
三、當年度與前一年度勞工保險投保單位被保險人名冊。
四、增僱員工之勞工保險被保險人投保資料表及薪資明細資料。
五、第五條規定之切結書。
六、其他有關證明文件。
前項申報表格之格式，由財政部定之。
中小企業依第一項規定填報之資料如有疏漏，得於所得稅法規定申報期限屆滿前補正；屆期未補正者，稅捐稽徵機關得不予受理。
第 7 條
中小企業申請優惠，其薪資費用支出，不包括政府補助款在內，且應以稅捐稽徵機關核定數為準。
第 8 條
中小企業有違反環境保護、勞工、食品安全衛生相關法律且情節重大者，中央主管機關應依稅捐稽徵法第四十八條第二項規定，通知財政部停止並追回其違章行為所屬年度享受本條例第三十六條之二第一加成減除營利事業所得額之優惠待遇。
第 9 條
中央主管機關首次公告經濟景氣指數達一定情形時，優惠適用期間溯及自中華民國一百零三年五月二十日起，連續適用二年。
第 10 條
本辦法施行期間，自中華民國一百零三年五月二十日起十年。

適用產業創新條例研發投資抵減者應於5月底前提出申請

有部分公司未依規定向主管機關申請認定當年度研發活動，或申請認定研發活動金額與結算申報適用投資抵減支出金額不一致，或嗣後全部或部分撤回原申請認定研發活動，因其結算申報時已抵減當年度應納營利事業所得稅，造成短繳稅款補徵稅款情形，補徵稅款並依所得稅法第100條之2規定加計利息。

公司申請適用產業創新條例研發投資抵減者，應於辦理當年度結算申報期間開始前3個月起至申報期間截止日內（以會計年度採歷年制之公司為例，應於2月至5月提出）填寫結算申報書租稅減免部分第10-1頁「依產業創新條例申報減免稅額通報單」及第15-2頁「產業創新條例研究發展支出適用投資抵減明細表」，檢具有關文件向中央目的事業主管機關申請認定當年度研究發展活動，始符合適用租稅優惠之資格。

阿甘創業加盟網提醒開店商家經營業者特別是連鎖加盟業業者，注意申請適用租稅獎勵之程序要件，且應於5月31日以前向中央目的事業主管機關提出申請，以符合獎勵要件。

近年來，隨著兩岸經濟的快速發展，加盟連鎖業到大陸開加盟連鎖店設中央工廠的情形已是非常普遍，加盟連鎖業業者如果將已申請抵減所得稅之機器設備，在交貨之次日起3年內，移轉給大陸子公司使用者，應向稅捐稽徵機關補繳已抵減之所得稅款，並自各抵減年度所得稅結算申報屆滿之次日起至繳納之日止，依中華郵政1年期定期儲金固定利率，按日加計利息，一併繳納。

移轉給大陸子公司使用者情形包括有轉借、出租、轉售、退貨、拍賣、失竊、報廢、經他人依法收回、與他人交換或其他無法供自行使用之情形。